• 平成6年
• 「とうきょうプラン95」（新規事業として計画）

• 平成10年
• 「都立重症心身障害児施設検討委員会」設置（センターの役割提示）

• 平成12年
• 「とうきょう構想2000」（事業規模の具体的提示）

• 平成15年9月
• 建設工事開始

• 平成16年3月
• 社会福祉法人 全国重症心身障害児(者)を守る会がセンターを運営する指定管理者に決定

• 平成16年4月
• 同上法人東京都立東部療育センター開設準備室設置

• 平成17年8月
• 建設工事完了

• 平成17年12月
• 一次開設

• 平成18年4月
• 全面開設

• 平成20年9月
• 乳幼児通所事業の開始

• 平成24年3月
• MRI設置

• 平成28年4月
• 保育所等訪問支援事業の開始